Badania mikroskopowe płytek cienkich obejmują szeroki zakres działań:

• pobór próbek do badań,
  
• przygotowanie próbek (w oparciu o zewnętrzną pracownię szlifierską),
  
• obserwacje w mikroskopie polaryzacyjnym.
  

Obserwacje mikroskopowe prowadzone są zarówno w świetle przechodzącym jak i w świetle odbitym. Wykorzystywane są preparaty zwykłe oraz opcjonalnie barwione alizaryną (określanie w szlifach rodzaju minerałów węglanowych) czy sporządzane na żywicy barwionej (celem uwidocznienia przestrzeni porowej). 

Celem obserwacji mikroskopowych są:

• określenie składu mineralnego,
  
• określenie struktury i tekstury badanych skał,
  
• określenie typu cementów,
  
• opis matriks (minerały, sposób wypełnienia przestrzeni porowej),
  
• określenie objętości przestrzeni porowej,
  
• obserwacje w świetle odbitym; określenie rodzaju minerałów nieprzeźroczystych.
  
  

Wyniki obserwacji mikroskopowych zestawiane są w postaci raportów zawierających opis badanych skał ilustrowane przykładowymi zdjęciami.

Badania mikroskopowe opcjonalnie uzupełniane mogą być przez badania dyfrakcyjne rentgenowskie (określenie składu mineralnego), obserwacje w mikroskopie skaningowym wraz z systemem mikroanalizy (SEM-EDS).